Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00862A6NCI5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms