Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSDA5PKW4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms