Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J9

TAF6L, TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6LQ9Y6J9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6LQ9Y6J9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6LQ9Y6J9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TAF6LQ9Y6J9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TAF6LQ9Y6J9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TAF6LQ9Y6J9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms