Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP16Q9Y5T5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP16Q9Y5T5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms