Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF6Q9Y4K3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms