Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M5

KLHL20, Kelch-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL20Q9Y2M5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL20Q9Y2M5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms