Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
NUDCQ9Y266 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUDCQ9Y266 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms