Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC5Q9UQL6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC5Q9UQL6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms