Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TNFSF18Q9UNG2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms