Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALKQ9UM73 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms