Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MRTO4Q9UKD2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms