Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RIMS3Q9UJD0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms