Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATPIF1Q9UII2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms