Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SCN11AQ9UI33 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms