Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHORDC1Q9UHD1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms