Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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CNTN3Q9P232 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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CNTN3Q9P232 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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CNTN3Q9P232 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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CNTN3Q9P232 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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CNTN3Q9P232 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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CNTN3Q9P232 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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CNTN3Q9P232 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CNTN3Q9P232 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CNTN3Q9P232 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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