Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GSKIPQ9P0R6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms