Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms