Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VNN3Q9NY84 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms