Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A12Q9NXJ0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms