Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXD4L1Q9NU39 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOXD4L1Q9NU39 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms