Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HELLSQ9NRZ9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELLSQ9NRZ9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms