Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SERINC1Q9NRX5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms