Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MEPEQ9NQ76 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MEPEQ9NQ76 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms