Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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LHX9Q9NQ69 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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LHX9Q9NQ69 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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LHX9Q9NQ69 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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LHX9Q9NQ69 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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LHX9Q9NQ69 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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LHX9Q9NQ69 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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LHX9Q9NQ69 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX9Q9NQ69 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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