Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NRIP3Q9NQ35 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms