Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP86

CABP5, Calcium-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP5Q9NP86 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CABP5Q9NP86 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CABP5Q9NP86 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms