Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZCCHC17Q9NP64 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms