Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1Q9HCU9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1Q9HCU9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms