Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LY9Q9HBG7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY9Q9HBG7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms