Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LIN28AQ9H9Z2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms