Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NRDE2Q9H7Z3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NRDE2Q9H7Z3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms