Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDGFDQ9GZP0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms