Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TDRD1Q9BXT4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD1Q9BXT4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD1Q9BXT4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD1Q9BXT4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD1Q9BXT4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD1Q9BXT4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD1Q9BXT4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD1Q9BXT4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD1Q9BXT4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD1Q9BXT4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms