Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SALL3Q9BXA9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SALL3Q9BXA9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms