Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RSG1Q9BU20 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RSG1Q9BU20 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms