Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF559Q9BR84 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms