Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
USB1Q9BQ65 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USB1Q9BQ65 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms