Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOL4Q9BPW4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOL4Q9BPW4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms