Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MYD88Q99836 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MYD88Q99836 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms