Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5SQ99766 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5SQ99766 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5SQ99766 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5SQ99766 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5SQ99766 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5SQ99766 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5SQ99766 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP5SQ99766 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms