Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PFDN5Q99471 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PFDN5Q99471 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms