Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms