Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS6KC1Q96S38 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS6KC1Q96S38 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms