Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf85Q96MD7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf85Q96MD7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf85Q96MD7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf85Q96MD7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf85Q96MD7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
C9orf85Q96MD7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf85Q96MD7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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