Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NBPF4Q96M43 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NBPF4Q96M43 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms