Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRRC1Q96M27 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms