Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD8Q96LT4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD8Q96LT4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms