Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCC11Q96J66 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCC11Q96J66 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms