Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCARF2Q96GP6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCARF2Q96GP6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms